菌株又稱品系，表示任何由一個(gè)獨(dú)立分離的單細(xì)胞（或單個(gè)病毒粒子）繁殖而成的純種群體及其后代。因此，一種微生物的每一個(gè)不同來源的純培養(yǎng)物均可稱為該菌種的一個(gè)菌株。根據(jù)菌株的定義，菌株實(shí)際上是某一微生物達(dá)到“遺傳性純”的標(biāo)志，一旦菌株發(fā)生變異，均應(yīng)標(biāo)上新的菌株名稱。當(dāng)進(jìn)行菌種保藏、篩選或科學(xué)研究時(shí)，在進(jìn)行學(xué)術(shù)交流或發(fā)表論文時(shí)，在利用菌種進(jìn)行生產(chǎn)時(shí)，都必須同時(shí)標(biāo)明該菌種及菌株名稱。 1、新引進(jìn)的菌種經(jīng)形態(tài)、染色、培養(yǎng)性狀、生化特性等的鑒別確定后作記錄，并進(jìn)行保存。
2、長(zhǎng)期保存的儲(chǔ)存菌株以冷凍干燥保藏為主，特殊要求的菌種可用其它方法進(jìn)行保存，保存期可長(zhǎng)達(dá)幾年至幾十年。
3、半儲(chǔ)存菌株以含20%甘油的肉湯或液體石臘封存的半固體瓊脂為主，在0℃以下保存，保存期為3－6個(gè)月。
4、應(yīng)用菌株以瓊脂斜面為主，在4℃保存，保存期為1－3個(gè)月。
5、菌種的傳代不可超過6次。視菌種的特性及使用情況，一般儲(chǔ)存菌株每5年傳記代一次，每1-2年從儲(chǔ)存菌株轉(zhuǎn)接至半儲(chǔ)存菌株，半儲(chǔ)存菌株每3-6個(gè)月傳代一次，每1-3個(gè)月從半儲(chǔ)存菌株轉(zhuǎn)接接至應(yīng)用菌株。
6、每次檢驗(yàn)用的菌株必須是從應(yīng)用菌株轉(zhuǎn)接的新鮮菌株。每支應(yīng)用菌株用兩次后必須銷毀（121℃，0.1MPa高壓**處理15分鐘以上）。
7、各級(jí)保存的菌株應(yīng)有明確的編號(hào)、名稱、傳代數(shù)、日期等到標(biāo)識(shí)。
8、菌種的收發(fā)、保存、使用、傳代等應(yīng)及時(shí)認(rèn)真詳細(xì)地登記，以備查核。
9、在保存過程中，如發(fā)生污染退化等問題，應(yīng)及時(shí)報(bào)告，以便處理。
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